Доцент кафедры криминалистики, заместитель заведующего кафедрой по научной работе, главный редактор федерального научно-практического журнала «Эксперт-криминалист», кандидат юридических наук, доцент Ярослава Комиссарова трудится в МГЮА с 2004 года.
Автор более 250 научных трудов, соавтор нескольких монографий и 7 учебников по криминалистике, в том числе учебника «Криминалистика», который вышел в свет в 2019 г. в издательстве «Проспект» под ред. А.И. Бастрыкина, Е.П. Ищенко, Я.В. Комиссаровой. В 2020 г. Университетом имени О.Е. Кутафина (МГЮА) номинировался на Национальную премию по литературе в области права. В 2024 году опубликовано 2-е издание, переработанное и дополненное.
Является одним из ведущих специалистов России в области теории и практики проведения исследований с применением полиграфа. С 2005 г. выступает соразработчиком, рецензентом методических рекомендаций по проведению психофизиологических экспертиз и исследований с применением полиграфа в системе МВД, ФСКН, Следственного комитета, военной полиции Вооруженных Сил Российской Федерации.
Автор первого отечественного учебника для магистратуры по новой дисциплине «Полиграфология» (М.: Проспект, 2016; 2-е изд. вышло в свет в 2022 г.). По направлению «создание высококачественных учебных изданий для системы образования Российской Федерации» был выдвинут Университетом на соискание премии Правительства Российской Федерации 2024 года в области образования.
Активно занимается воспитательной работой. С 2021 г. по ее инициативе кафедра ежегодно проводит приуроченный к празднованию Дня Победы межвузовский студенческий круглый стол «Памяти учителей», посвященный выдающимся отечественным ученым-криминалистам. В 2023 г. инициировала проведение ежегодного Всероссийского конкурса молодых ученых на лучшую научную статью в журнал «Эксперт-криминалист» имени профессора В.И. Комиссарова», который проводится совместно Московской академией Следственного комитета РФ имени А.Я. Сухарева, кафедрами криминалистики Саратовской государственной юридической академии и Университета.
Востребованный педагог-наставник Я.В. Комиссарова регулярно проводит занятия со слушателями курсов повышения квалификации адвокатов, а также будущими полиграфологами, обучающимися в АНО ДПО «Центр прикладной психофизиологии».
Член Организационного комитета Национальной премии по литературе в области права, Британской и Европейской ассоциации полиграфологов, почетный член Евразийской ассоциации полиграфологов, член Российского профессорского собрания, Российской академии юридических наук, экспертного совета НП «Национальная коллегия полиграфологов» и Международной Ассоциации экспертов в области психологии и права (Россия), Я.В. Комиссарова за успехи в учебной, научной, общественной работе неоднократно поощрялась руководством вуза и правоохранительных органов.